全自动洗瓶机可以对实验室常用实验器皿(锥形瓶、烧杯、试管、移液管、试剂瓶、烧瓶、培养皿等)进行清洗、消毒、干燥全自动处理。
全自动洗瓶机由于需要频繁的接触酸和碱，需要对各种化学物质有一定的耐受性，通常选择高性能的不锈钢材料制作。尽管如此，定期对设备进行保养仍然是必须的。这样可以确保设备随时处于可用状态，延长设备的使用寿命。
全自动洗瓶机有些频繁转动的部件，如蠕动泵及其软管、循环泵等需要定期进行检查和更换配件，以确保清洗剂可以按照设定的数值正常吸入，设备正常运转。长期停机不用也有可能会导致某些阀门失效或者杂质堵塞管道等。保养工作可以由内部的设备工程师完成，也可以外包给设备厂商完成。对自动清洗机进行定期的保养，有利于长期的、高效的使用设备，发挥设备的最大价值。
由于全自动洗瓶机的循环、喷淋等作用，普通的清洗剂含有表面活性剂，会形成大量的泡沫。这些泡沫一方面会溢出来，另一方面也有可能导致循环泵的损坏，所以全自动洗瓶机只能使用无泡沫或低泡沫的清洗剂。
专用的清洗剂不仅含有碱或酸，还有螯合剂、络合剂等多种活性物质。通过这些活性物质的协同作用更好地溶解和分散残留物。此外，清洗溶液不仅要有去除残留物的清洗能力，还不能损坏设备的表面和管路。设备厂商在推荐清洗剂时，都经过细致的测试与评估，确认满足各方面的条件才可以使用。
如果清洗剂自己配制，由于不了解设备的材料特性，很容易导致设备损坏，将会得不偿失。选择稳定高质量的专用清洗剂，不仅能够发挥设备的潜力，延长全自动洗瓶机的使用寿命，还能很大程度的确保清洗工艺的稳定性和可重复性。
